Biomarker-Journal Offener Zugang

Abstrakt

Zirkulierende freie DNA im Serum und genomische Veränderungen bei Lungenkrebspatienten und Hochrisikopersonen, die Umweltverschmutzung ausgesetzt sind

Marta A, Carolina T, Ulises U, Lionel G, Jose D, Marco C, Monica C, Alcides Z, Hugo B, Pedro M und Veronica RM

Der Einsatz von Technologien zur Früherkennung und prognostischen Biomarkern ist zwingend erforderlich, insbesondere in Städten mit einer hohen Belastung durch Umweltkarzinogene wie PAK und Arsen. In dieser Studie sollten die cfDNA-Werte ausgewertet und CNAs in Serum-cfDNA von Patienten mit LC und PNL bestimmt werden. An der Studie nahmen insgesamt 107 Personen aus der Metropolregion (N=51) und Antofagasta (N=56) mit mittlerem oder hohem LC-Risiko teil. Die cfDNA wurde mithilfe des Qiagen QIAamp DNA Mini-Kits aus Serumaliquots isoliert. Die HMM-Analyse in cfDNA wurde als Wahrscheinlichkeitsmodell zur Bestimmung einer unbekannten Sequenz verwendet und definierte minimale gemeinsame Regionen (MCRs) wiederkehrender DNA-Gewinne und -Verluste. Diese Studie zeigt, dass die cfDNA-Werte während der Malignität von LC anstiegen, jedoch nicht signifikant während prämaligner Läsionen oder präinvasiver Stadien. Die cfDNA könnte als ergänzendes Instrument zur Prognose und Entwicklung von LC mit hoher Präzision (Spezifität von 87,3 % und PNV von 76,4 %) verwendet werden. Darüber hinaus weist die cfDNA einige Chromosomenaberrationen auf, die mit dem Prozess der Lungentumorentstehung in Zusammenhang stehen und zur Bestätigung eines vermuteten LC-Falls verwendet werden könnten. Innerhalb dieser Veränderungen deuten unsere Ergebnisse auf den Verlust spezifischer Chromosomenfragmente hin, die Gene enthalten, die mit der Entzündungsreaktion (SERPING1), der humoralen Immunreaktion (IGCK), der angeborenen Immunität und Epithelintegrität (CTNN1), dem Tumorsuppressor (MAP2K4, DMTF1 und ABCB4) und der Reaktion auf oxidativen Stress (COX10) in Zusammenhang stehen. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass diese Biomarker in cfDNA ein großes Potenzial als Screening-Methoden bei Bevölkerungsgruppen mit hohem LC-Risiko haben könnten.