Zeitschrift für Alzheimer und Demenz Offener Zugang

Abstrakt

In silico Identifizierung eines neuen ApoE4-Inhibitors zur Therapie der Alzheimer-Krankheit

Muhammad Asif Rasheed

ApoE4 ist ein bedeutender genetischer Risikofaktor, da es die Inzidenz von Alzheimer erhöht. Ziel der Studie war es, Verbindungen vorherzusagen, die bei der Entwicklung von Medikamenten zur Unterdrückung der Überaktivität des ApoE4-Proteins hilfreich sein könnten. 22 natürliche Verbindungen (marine, mikrobielle und pflanzliche Derivate) wurden als Inhibitoren verwendet und an ApoE4 (PDB-ID 1B68) angedockt. 6 synthetische Verbindungen (in klinischen Studien) wurden an das Zielprotein angedockt, um die Andockergebnisse mit natürlichen Verbindungen zu vergleichen und zu analysieren. Die Verbindungen S-Allyl-L-Cystein, Epicatechin-Gallat und Fulvosäure weisen eine hohe Bindungsaffinität von -7,1, -7 bzw. -7 auf. Epicatechin-Gallat zeigt Wasserstoffbrücken mit Gln156 und Asp35 und Fulvosäure zeigt Wasserstoffbrücken mit Glu27. Bei synthetischen Verbindungen zeigte Tideglusib keine Wasserstoffbrücken mit einem Aminosäurerest von ApoE4, zeigte aber eine hohe Bindungsaffinität von -7,2, genau wie die natürliche Verbindung S-Allyl-L-Cystein, die eine hohe Bindungsaffinität von -7,1 zeigte, aber keine Wasserstoffbrücken mit einem Aminosäurerest. Protein-Protein-Interaktionen von ApoE4 zeigen physikalische und funktionelle Interaktionen mit verwandten Proteinen. Unsere Studie sagt eine Verbindung Epicatechin-Gallat auf der Grundlage der Bindungsaffinität und Wasserstoffbrücken mit Aminosäureresten als potenzielle Leitverbindung voraus, die als Inhibitor verwendet werden kann.