Die aquatische Toxikologie ist ein multidisziplinärer Zweig, der die Untersuchung natürlicher und synthetischer Giftstoffe und ihrer Auswirkungen umfasst, die zur Toxizität aquatischer Systeme führen. Dabei handelt es sich um einen Bereich der Wissenschaft, der sich auf die Untersuchung verschiedener chemischer und physikalischer Toxine konzentriert, die biologische Lebewesen beeinflussen. Quellen der aquatischen Toxikologie können auch persistente Toxine wie PCB, DDT, TBT, Pestizide, Furane, Dioxine, Phenole und radioaktive Abfälle sein, die durch direkte Einleitungen über industrielle und städtische Abwässer, Oberflächenabflüsse und indirekt durch Fallout aus der Luft entstehen.